Персонализированная медицина
-
От агностических биомаркеров к клиническим исследованиям одного пациента: эволюция или революция?
Тенденции в области лечения рака. 2020 Sep 29;S2405-8033(20)30241-7.
Jacob J Adashek, Vivek Subbiah, Razelle KurzrockПрецизионная медицина использовала секвенирование нового поколения (NGS), таргетные препараты и иммунотерапию, чтобы изменить прогноз самых тяжелых онкологических заболеваний. В частности, в настоящее время существует несколько препаратов, одобренных Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов препаратов США и при наличии определенных биомаркеров при любом типе опухоли: пембролизумаб при микросателлитной нестабильности и мутационной нагрузке опухоли (TMB) ≥10 мутаций/Мб и ларотректиниб/энтректиниб при перестройках генов NTRK. Молекулярные исследования продолжат показывать, что метастатические опухоли чрезвычайно сложны и индивидуальны. Поэтому оптимизированное лечение часто требует комбинации лекарств (не монотерапии) и индивидуального подхода N-of-one – клиническое исследование с участием одного пациента. Первые исследования этого подхода показывают целесообразность, безопасность и эффективность. Данные реальной клинической практики/основные регистрационные испытания могут также дать большой объем клинически значимых данных, которые еще больше стимулируют эволюцию в онкологии.
Ключевые слова: генетика опухоли; внеклеточная ДНК; циркулирующая опухолевая ДНК; секвенирование нового поколения; прецизионная онкология.
-
Геномные и транскриптомные биомаркеры ответа на ингибиторы иммунных контрольных точек при прогрессирующих солидных опухолях
Clin Cancer Res. 2020 Oct 5;clincanres.1163.2020.
Alexandra Pender, Emma Titmuss, Erin D Pleasance, Kevin Y Fan, Hillary Pearson, Scott D Brown, Cameron J Grisdale, James T Topham, Yaoqing Shen, Melika Bonakdar, Greg Taylor, Laura M Williamson, Karen L Mungall, Eric Chuah, Andrew J Mungall, Richard A Moore, Jean-Michel Lavoie, Stephen Yip, Howard Lim, Daniel J Renouf, Sophie Sun, Robert A Holt, Steven Jm Jones, Marco A Marra, Janessa LaskinЦель: Ингибиторы иммунных контрольных точек (ИКТ) показывают революционные результаты и демонстрируют длительные и стойкие ответы при лечении различных типов опухолей. Однако идентификация пациентов, отвечающих на иммунотерапию, остается сложной задачей, особенно в поздних стадиях заболевания и у предлеченных пациентов.
Дизайн исследования: Мы проанализировали образцы ткани опухолей 98 пациентов с метастатическими опухолями, в основном уже получавшим лечение. Тестирование проводилось с использованием анализа всего генома и транскриптома (WGTA) с помощью персонализированной программы Онкогеномики (POG) при исследовательском центре BC Cancer. Исходные характеристики и данные о динамическом наблюдении были собраны ретроспективно.
Результаты: Мы обнаружили, что мутационная нагрузка опухоли (TMB), независимо от статуса системы репарации неспаренных оснований, была наиболее явным предиктивным маркером большего времени до прогрессирования на иммунотерапии (ВДП, р=0,007). Показатели соотношения иммунных CD8+ Т-клеток и макрофагов М1-М2 показали были лучшим предиктором большей общей выживаемости (ОВ) (р=0,0014 и 0,0012 соответственно). В то время как экспрессия гена CD274 (PD-L1) сравнима с уровнями белка, обнаруженными при иммуногистохимическом исследовании (ИГХ), мы не наблюдали благоприятного клинического эффекта для пациентов с этим маркером. Результаты данного исследования продемонстрировали, как комбинация маркеров на основе анализа WGTA обеспечивает наилучшую стратификацию пациентов (p=0,00071, OВ), а также представлен пример возможной приобретенной резистентности к пембролизумабу у пациента с немелкоклеточным раком легкого (НМРЛ).
Заключение: Интерпретация результатов взаимодействия по линии противоопухолевого иммунного ответа для прогнозирования эффективности ИКТ остается сложной задачей. Анализ WGTA позволяет идентифицировать несколько биомаркеров одновременно, такая комбинация может помочь идентифицировать пациентов с положительным ответом на лечение, особенно в отношении гетерогенной группы пациентов с поздними стадиями и предлеченных пациентов.
M-RU-00001613 Декабрь 2020